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May 4, 2011, 3:05:03 AM (14 years ago)

Author:

jazz

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jazz/11-05-04

@@ -16 +16 @@
 ~/velvet_1.1.03$ ./velvetg output/ -exp_cov 3 -min_contig_lgth 100
 }}}
+ * <參考#1> [http://blog.dccmx.com/2011/01/gprof/ 讓程序飛 之 性能工具: gprof & gprof2dot]
+ * <參考#2> [http://blog.dccmx.com/2011/01/valgrind-memcheck/ 讓程序飛 之 內存工具: valgrind –tool=memcheck]
+ * <參考#3> [http://blog.dccmx.com/2011/01/valgrind-massif/ 讓程序飛 之 內存工具: valgrind –tool=massif & massif-visualizer]
+ * <參考#4> [http://blog.dccmx.com/2011/01/callgrind/ 讓程序飛 之 性能工具: valgrind –tool=callgrind & kcachegrind]
  * 使用 [http://packages.debian.org/valgrind valgrind] 來進行記憶體分析 - (1) Memory Leak 分析
 {{{
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 }}}
  * 使用 [http://packages.debian.org/valgrind valgrind] 的 [http://valgrind.org/docs/manual/ms-manual.html Massif] 工具來進行記憶體分析 - (2) Memory Usage 分析
- * Valgrind's skin Massif ('valgrind --tool=massif application') traces memory usage of the application.[http://ktown.kde.org/~seli/memory/analysis.html 參考#1]
+ * Valgrind's skin Massif ('valgrind --tool=massif application') traces memory usage of the application.[http://ktown.kde.org/~seli/memory/analysis.html 參考來源]
 {{{
 ~/velvet_1.1.03$ valgrind --tool=massif ./velveth output 17 -fasta -short data/test_long.fa
@@ -116 +120 @@
  * 使用 gprof 進行 profile 分析
 {{{
-~/velvet_1.1.03$ cat Makefile | sed "s#^CFLAG.*#CFLAGS = -Wall -pg#" > 
+~/velvet_1.1.03$ cat Makefile | sed "s#^CFLAG.*#CFLAGS = -Wall -pg#" > Makefile.new
 ~/velvet_1.1.03$ mv Makefile.new Makefile
 ~/velvet_1.1.03$ make