close Warning: Can't synchronize with repository "(default)" (Unsupported version control system "svn": /usr/lib/python2.7/dist-packages/libsvn/_fs.so: failed to map segment from shared object: Cannot allocate memory). Look in the Trac log for more information.

Changes between Version 5 and Version 6 of biocluster/BLAST


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Timestamp:
Sep 16, 2009, 12:51:16 PM (16 years ago)
Author:
wade
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  • biocluster/BLAST

    v5 v6  
    33 * http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/
    44 * Debian 套件: [http://packages.debian.org/blast2 blast2]
    5 
    6 
    7 = 【說明】 =
    8 
    9 
    105
    116= 【安裝】 =
    … …  
    149}}}
    1510
    16 
    17 
    18 = 【執行】 =
    19 
    20 
    21 
    2211= 【測試】 =
    2312資料庫：
    2413 * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/
    2514 * ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.21-ia32-linux.tar.gz
     15
     16 1. 指令：
     17    {{{
     18formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt
     19    }}}
     20    輸出檔案：bl2seq.out
     21 1. 指令：
     22    {{{
     23formatdb -i nt.ests -p F -o T -n test.nt
     24    }}}
     25    輸出檔案：
     26      * test.nt.nhr  test.nt.nsd
     27      * test.nt.nin  test.nt.nsi
     28      * test.nt.nnd  test.nt.nsq
     29      * test.nt.nni  formatdb.log
     30 1. 指令：
     31    {{{
     32fastacmd -d test.nt -s 5986
     33    }}}
     34